यह अनेक द्वीपों से मिलकर बना है लेकिन होकैडो, होंशू , शिकोकू और क्यूशू चार प्रमुख द्वीप हैं, जिन पर जापान की अधिकांश जनसंख्या निवास करती है।
इनमे होंशू द्वीप सबसे बड़ा और सबसे अधिक आबादी वाला द्वीप है जिस पर जापान की राजधानी ‘टोक्यो’ स्थित है। इसी द्वीप पर सुसुप्त ज्वालामुखी (Dormant Volcano) ‘फ्यूजीयामा’ भी स्थित है।
ओसाका को ‘जापान का मैनचेस्टर’ और नगोया को ‘जापान का डेट्रॉयट’ कहा जाता है।
‘क्योटो’ जापान की पुरानी राजधानी होने के साथ-साथ हस्तकला उद्योग के लिये भी प्रसिद्ध है।
क्युशू द्वीप पर नागासाकी शहर और होंशू द्वीप पर हिरोशिमा स्थित है, जिन्होंने द्वितीय विश्व युद्ध में परमाणु बम का विध्वंस भी झेला था ।